Catherine Malabou nasceu em Sidi Bel Abbès, na Argélia, em 1959. Graduou-se em filosofia na Universidade de Paris–Sorbonne, na França. Em 1989, fez parte da Comissão de Filosofia e Epistemologia do Ministério da Educação da França, que elaborou um relatório sobre os métodos de ensino da filosofia no ensino básico e superior. Concluiu o doutorado em filosofia na École des Hautes Études en Sciences Sociales sob orientação de Jacques Derrida em 1994. De 1995 a 2011, foi professora assistente de filosofia na Universidade de Paris–Nanterre e em 2011 passou a atuar também no Centro de Pesquisa em Filosofia Europeia Moderna (CRMEP) na Kingston University London, no Reino Unido. Em 2016, ingressou nos departamentos de Literatura Comparada e Línguas e Estudos Europeus na Universidade da Califórnia em Irvine, nos Estados Unidos, tendo atuado anteriormente como professora visitante em outras instituições acadêmicas nos Estados Unidos, entre elas a Universidade da Califórnia em Berkeley, The New School, Universidade do Estado de Nova York em Buffalo, Universidade de Wisconsin em Madison, Universidade da Califórnia em Los Angeles e Universidade Johns Hopkins. Desde 2017, é professora de filosofia na European Graduate School (EGS).